Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHORDC1Q9UHD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms