Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT8Q9UFF9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms