Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-2Q9UD57 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms