Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEF1Q9UBV8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEF1Q9UBV8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms