Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DKK4Q9UBT3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms