Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTRRQ9UBK8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRRQ9UBK8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTRRQ9UBK8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTRRQ9UBK8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRRQ9UBK8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRRQ9UBK8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRRQ9UBK8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms