Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1V8

SAMD15, Sterile alpha motif domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD15Q9P1V8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD15Q9P1V8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD15Q9P1V8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD15Q9P1V8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms