Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMG20BQ9P0W2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HMG20BQ9P0W2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HMG20BQ9P0W2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms