Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAPAQ9P0L0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms