Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD3Q9P035 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms