Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNOT2Q9NZN8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNOT2Q9NZN8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms