Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP1Q9NZ09 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1Q9NZ09 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms