Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BARHL2Q9NY43 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BARHL2Q9NY43 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms