Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDE1Q9NXR1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDE1Q9NXR1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms