Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKS1Q9NXB0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms