Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB20Q9NX57 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB20Q9NX57 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms