Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH5Q9NX47 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH5Q9NX47 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms