Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW07

ZNF358, Zinc finger protein 358, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF358Q9NW07 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF358Q9NW07 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF358Q9NW07 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF358Q9NW07 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms