Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL11Q9NVR0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL11Q9NVR0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms