Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASF1BQ9NVP2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms