Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXD2Q9NVH0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms