Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMP3Q9NV31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms