Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF13Q9NV06 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF13Q9NV06 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms