Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GINM1Q9NU53 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GINM1Q9NU53 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms