Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPMQ9NSP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.1 ms