Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK0

KLC4, Kinesin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC4Q9NSK0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC4Q9NSK0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC4Q9NSK0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC4Q9NSK0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC4Q9NSK0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLC4Q9NSK0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLC4Q9NSK0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLC4Q9NSK0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLC4Q9NSK0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLC4Q9NSK0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLC4Q9NSK0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms