Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SALL1Q9NSC2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SALL1Q9NSC2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms