Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A11Q9NSA0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A11Q9NSA0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms