Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPRMQ9NS64 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPRMQ9NS64 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPRMQ9NS64 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPRMQ9NS64 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPRMQ9NS64 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPRMQ9NS64 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPRMQ9NS64 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRMQ9NS64 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms