Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDHAF3Q9NRP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms