Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHB16Q9NRJ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHB16Q9NRJ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms