Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRTFDC1Q9NRG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms