Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN5Q9NRC6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN5Q9NRC6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN5Q9NRC6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms