Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHST12Q9NRB3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms