Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF4Q9NR80 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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