Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIT2Q9NQR4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms