Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN4Q9NQP4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PFDN4Q9NQP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms