Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TREM1Q9NP99 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TREM1Q9NP99 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms