Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CENPJQ9HC77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CENPJQ9HC77 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms