Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP29Q9HBJ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP29Q9HBJ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms