Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVBQ9HBI1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARVBQ9HBI1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVBQ9HBI1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms