Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms