Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAE3

EFCAB1, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB1Q9HAE3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB1Q9HAE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFCAB1Q9HAE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB1Q9HAE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms