Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ELP3Q9H9T3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ELP3Q9H9T3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms