Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FKRPQ9H9S5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FKRPQ9H9S5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FKRPQ9H9S5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FKRPQ9H9S5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FKRPQ9H9S5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FKRPQ9H9S5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FKRPQ9H9S5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FKRPQ9H9S5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms