Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CATSPERBQ9H7T0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CATSPERBQ9H7T0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPERBQ9H7T0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms