Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM12Q9H4Q4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms