Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED28Q9H204 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms