Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH19Q9H159 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH19Q9H159 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH19Q9H159 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH19Q9H159 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms