Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SPRTNQ9H040 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms